در قلب دوربین فول‌فریم 6D Mark II یک سنسور ۲۶.۲ مگاپیکسل (با ویژگی فوکوس اتوماتیک دوال پیکسل) به همراه پردازشگر DIGIC7 نهفته است. حداکثر میزان حساسیت به نور (ISO) در این دوربین برابر با ۴۰,۰۰۰ است و همانند EOS 80D از سنسور اندازه‌گیری ۷۵۶۰ پیکسلی RGB+IR استفاده می‌کند. زمانی که از نمایاب برای عکاسی استفاده کنید، سیستم اتوفوکوس ۴۵ نقطه‌ای به‌صورت کراس در اختیار شما قرار می‌گیرد. سرعت عکاسی پیاپی مارک ۲ با فوکوس اتوماتیک پیوسته، به ۶.۵ فریم بر ثانیه می‌رسد. جدول زیر مقایسه‌ی کاملی از دوربین 6D Mark II را با مدل قدیمی‌تر در اختیار شما قرار می‌دهد. در زمان نگارش این مطلب، تست‌های آزمایشگا‌هی در دسترس نبود؛ ولی با توجه به سنسور ۲۶.۲ مگاپیکسلی انتظار عکس‌های بهتری نسبت به دوربین 6D با سنسور ۲۰ مگاپیکسلی داریم.

در بخش فیلم‌برداری، این دوربین توانایی ضبط کلیپ با رزولوشن فول اچ‌دی و نرخ ۶۰ فریم بر ثانیه دارد. انتظار می‌رود مارک ۲ به لطف سیستم فوکوس خودکار دوال پیکسل، تجربه‌ی بهتری از فیلم‌برداری در اختیار کاربر قرار دهد. محصول جدید کانن از جک میکروفن خارجی نیز بهره می‌برد؛ ولی اگر دنبال دوربینی با خروجی هدفون هستید، باید دنبال 5D Mark IV باشید.

6D Mark II شامل تمامی امکانات بی‌سیم از جمله NFC و بلوتوث است و مانند مدل قدیمی‌تر، از GPS بهره می‌برد. خوشبختانه باطری این دوربین مثل سایر DSLR‌-های کانن از E6N استفاده می‌کند.